1.主处理功能。
　　要完成会计业务的一般工作，正确处理会计业务流程，进行填制会计凭证，登记会计帐本，输出财会信息等工作。一般商品化软件，主处理功能都比较齐全，不管是帐务子系统还是其他子系统，都不可缺少地拥有输入功能，处理功能和输出功能，但格式和处理方法各有不同。
　　2.辅助功能。
　　这是为主处理功能服务的，提供各种功能，以方便主处理功能的完满完成。没有这些功能,主处理功能也照样能完成，但有了这些辅辅助功能，使系统使用起来更加方便。辅助功能包括提示功能、帮助功能、引导操作功能、全屏编辑功能、辅助计算器等一切有利于用户使用软件系统的所有功能。
　　3.服务功能。
　　这是AIS系统有别于其他系统的特殊功能之一，它担负着会计信息系统的后勤保障任务,从而保证会计信息系统的正常运行。它包括：重建索引文件，以恢复被破坏的数据秩序，复制会计数据档案，以防其丢失,恢复会计信息系统以及其已失或已被破坏的数据，清理存储空间等功能。
　　4.控制功能。
　　它完成内部控制在会计信息系统中的任务，制约会计信息系统按规范的、正确的会计工作流程进行处理，并防止非法的和错误的输入、输出以及操作处理。它包括：输入数据的正确性控制(包括性质、长度、范围等)，输出内容使用的控制,正确处理顺序和方式的控制,使用权限的控制等系统控制功能。虽然控制功能不象其他功能可以直接从界面上看出，但它们确实存在于整个系统中，而且是必不可少的，控制功能越丰富，系统安全性越高,系统正常运行就越有保证。

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